전입생이 기계공학 심화 프로그램의 참여를 희망하는 경우 다음과 같은 규정에 의하여 학점인정과 학습성과 성취도에 대한 수용을 하게 되는데 우선 다음과 같은 기본 개념이 적용되고 있다.
대학차원의 제도와 절차가 아님(무조건 00학점 이상 인정하여 수용은 아님)
공학인증 적용된 학생과의 질적 동등성을 입증(전입생)편입(복학, 전과)의 엄격한 학점 인정 절차: 교과내용/학습성과 등의 동등성 심사, 계절학기와 특별프로그램 운영으로 보충

기본적으로 공학인증을 위한 프로그램이 아닌 비인증 과정에서의 전입생의 수용은 전적 학교에서 이수한 과목 중 기계공학 심화 프로그램의 교과목과 동일하거나 유사한 교과목이 있어 당해 교과목의 이수를 인정받고자 하는 경우에는 해당 교과목에 대한 성적증명서를 첨부하여 학점인정을 신청하고 필요에 따라서 평가시험을 통하여 학점 인정을 결정하게 된다. 학점인정 기준은 성적평가관리 위원회에서 담당을 하게 된다. 공학인증을 위한 프로그램에서 전입하는 경우는(복학생 또는 재입학생도 해당) 학생 포트폴리오와 성적증명서 등의 제출을 심사하여 성적평가관리위원회가 인정을 결정하게 된다. 그림에 전입생 수용절차를 나타내고 있다.

[공학인증프로그램 시행세칙]
제4조(프로그램 이동) ① 공학교육인증제도 운영 프로그램 이수를 신청한 학생이 다음 각 호의 어느 하나에 해당하는 사유로 인증기준을 충족할 수 없다고 판단될 경우에는 지도교수의 상담을 거쳐 일반 프로그램을 이수할 수 있다.
1. 공동학위과정, 특별과정 등을 병행하는 경우
2. 복수전공을 이수하는 경우
3. 부전공을 이수하는 경우
4. 그 밖에 사정으로 희망 재학기간 내에 인증기준을 충족할 수 없는 경우
② 제1항에 불구하고, 2012학년도 이후 해당 학부(과)에 신입학한 주간학생과 2019학년도 이후에 해당 학부(과)에 편입학,재입학,전과한 주간학생은 다음 각 호의 어느 하나에 해당하는 사유에 해당하는 경우에만 일반 프로그램을 이수할 수 있다.
1. 공동학위과정을 병행하는 경우
2. 복수전공을 이수하는 경우

* 2012학년도 이후 신입학한 주간학생은 단일인증제도를 적용함.
* 2019학년도 이후 편입학,재입학,전과한 주간학생은 단일인증제도를 적용함.